考慮病理性黃疸，則根據臨床表現和輔助檢查進行病因診斷。常見的有以下幾方面：

　　(1)以未結合膽紅素增高為主 ①新生兒血型不合溶血病，見新生兒溶血病。②葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(G-6-PD)缺陷癥：在南方發病率較高，蠶豆、磺胺藥、抗瘧藥、樟瑙丸等為誘發因素。③感染性黃疸：敗血癥、尿路感染、感染性肺炎等均可引起黃疸加深。④母乳性黃疸：可分為早發型和晚發型，早發型發生在生后第1周，與熱卡攝入不足和腸肝循環增加有關。晚發型在生后第5d開始出現，第2 周達高峰，與母乳中存在遏制因子和腸肝循環增加有關，患兒一般情況較好，暫停母乳 3 ～ 5d黃疸減輕。⑤其它：頭顱血腫、顱內出血、其它部位出血、窒息、藥物(維生素 K3.磺胺藥、新霉素等)、紅細胞增多癥、胎糞延遲排出、克-納氏綜合癥等均可引起黃疸。

　　(2)以結合膽紅素增高為主 ①新生兒肝炎：如甲型肝炎、乙型肝炎、巨細胞病毒肝炎、弓形體病等。②膽汁瘀滯綜合征：某些藥物、靜脈營養、敗血癥等可引起膽汁瘀滯。③膽道疾病：先天性膽道閉鎖、膽總管囊腫等。④先天性代射疾病：如甲狀腺功能低下、半乳糖血癥、α-抗胰蛋白酶缺乏癥等。